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毛利侦探事务所突然接到一通威胁电话。之后,路上的汽车就在小五郎的眼前爆炸了!“蓝色的少年与蓝色的斑马,从天而降的雨……”根据犯人寄来的挑战书,若不能解读谜之暗号,便无法阻止接下来的爆炸。小五郎和毛利兰在米花市内来回奔走,却完全找不到破解暗号的方法。另一方面,此时的江户川 柯南与灰原和少年侦探团一起,沉浸在观看最爱的足球比赛的快乐之中。正当比赛渐入佳境之时,从兰打来的电话那里,柯南得知了威胁电话的事情。柯南为了解读暗号独自一人离开赛场,却得知了无人能够阻止的恐怖事实……
本片为《名侦探柯南》第16部剧场版。